São órgãos da LAGOS-EM-FORMA:
a) O Conselho de Administração;
b) O Fiscal Único;
c) O Conselho Geral.
- Os membros do Conselho de Administração e o Fiscal Único são nomeados e exonerados pela Câmara Municipal de Lagos.
- O mandato dos titulares dos órgãos da Empresa Municipal é coincidente com o dos titulares dos órgãos autárquicos, sem prejuízo dos actos de exoneração e da continuação de funções até à efectiva substituição
Conselho de Administração
Presidente: Prof. José Manuel Dias
Administrador-Delegado: Prof. Francisco Quitéria
Administrador: Dr. Paulo Tovar de Morais
Fiscal Único:
Dr. Moisés Teixeira
Conselho Geral
O Conselho Geral é o órgão consultivo da LAGOS-EM-FORMA, composto por um representante da Assembleia Municipal de Lagos, por um representante da Câmara Municipal de Lagos, por dois representantes das organizações desportivas directamente relacionadas com as actividades desenvolvidas pela Empresa Municipal, por um representante dos utentes e por um representante dos trabalhadores.